157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1592 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1592  protein of unknown function DUF519  100 
 
 		 285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.495582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  51.46 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  51.46 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  53.65 
 
 		 285 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  53.26 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  52 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  49.64 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  53.62 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  49.1 
 
 		 286 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  47.46 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  44.91 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  46.72 
 
 		 286 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  42.96 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  47.1 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  45.59 
 
 		 289 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  49.27 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  46.4 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  44.12 
 
 		 283 aa  228  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  45.05 
 
 		 290 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  44.12 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  46.72 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  43.37 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  47.08 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  40.94 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  44.76 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0920  hypothetical protein  46.54 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.027603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  45.56 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  38.43 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  38.79 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  37.23 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  36.52 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  44.1 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0856  protein of unknown function DUF519  45 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.587944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  38.33 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  42.65 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  37.85 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  38.32 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  38.32 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  38.32 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  38.32 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  35.54 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  38.32 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  37.5 
 
 		 284 aa  185  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  39.19 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  37.15 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  36.17 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  37.59 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  37.15 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  36.43 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  37.15 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  40.7 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  42.05 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  38.14 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  36 
 
 		 280 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  37.15 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  37.15 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  36.46 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  37.15 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  35.44 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  36.36 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  36.14 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  36.36 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  36.36 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  36 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  36.73 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  39.05 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  36.13 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  36 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  35.56 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  36 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  36 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  36 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  36 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  38.32 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  35.66 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  40.57 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  35.64 
 
 		 280 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  35.9 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  38.78 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  38.7 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2382  hypothetical protein  38.01 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0256369  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  39.25 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  37.46 
 
 		 278 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  35.64 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  37.46 
 
 		 278 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  35.64 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  35.46 
 
 		 280 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  35.42 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  35.59 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  36.07 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  35.64 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0355  protein of unknown function DUF519  40.22 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0176  hypothetical protein  40.22 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  35.79 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  37.81 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  36.59 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  36.75 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  37.06 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  37.82 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>