155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1970 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  62.72 
 
 
290 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  66.06 
 
 
305 aa  360  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  62.89 
 
 
290 aa  359  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  59.33 
 
 
288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  58.21 
 
 
283 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  56.34 
 
 
290 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  58.58 
 
 
289 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  57.84 
 
 
289 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  51.25 
 
 
282 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  49.82 
 
 
286 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  51.61 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  49.82 
 
 
282 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  47.84 
 
 
285 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  48.58 
 
 
285 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  50.18 
 
 
286 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  48.76 
 
 
284 aa  266  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  49.64 
 
 
285 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  48.03 
 
 
286 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  48.56 
 
 
285 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  48.03 
 
 
282 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0920  hypothetical protein  47.92 
 
 
268 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.027603  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  46.21 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  47.16 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  46.1 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  48.94 
 
 
275 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  49.08 
 
 
300 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0856  protein of unknown function DUF519  48.33 
 
 
268 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.587944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  42.91 
 
 
280 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  47.06 
 
 
278 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  42.91 
 
 
280 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  42.91 
 
 
280 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  44.12 
 
 
280 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  44.49 
 
 
280 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  44.85 
 
 
280 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  44.85 
 
 
280 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  46.69 
 
 
278 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  44.85 
 
 
280 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  44.85 
 
 
280 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  44.85 
 
 
280 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  48.9 
 
 
282 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  42.2 
 
 
280 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  43.75 
 
 
280 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  45.9 
 
 
278 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  43.38 
 
 
280 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  43.75 
 
 
280 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  43.38 
 
 
280 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  43.38 
 
 
280 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  43.38 
 
 
280 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  43.75 
 
 
280 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  43.75 
 
 
280 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  45.15 
 
 
278 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  43.38 
 
 
280 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  41.84 
 
 
280 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  41.91 
 
 
280 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  42.7 
 
 
279 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  42.28 
 
 
280 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  42.2 
 
 
278 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  42.2 
 
 
278 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  41.95 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  41.57 
 
 
285 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1592  protein of unknown function DUF519  45.99 
 
 
285 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.495582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  45.16 
 
 
273 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  41.95 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  40.64 
 
 
284 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  45.15 
 
 
279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  41.34 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  43.46 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  39.93 
 
 
281 aa  215  8e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  43.66 
 
 
278 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  44.04 
 
 
285 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  43.26 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  43.68 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  37.78 
 
 
280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  50 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  45.59 
 
 
281 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  38.03 
 
 
280 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  41.49 
 
 
285 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  39.85 
 
 
292 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  40.07 
 
 
281 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2915  hypothetical protein  43.22 
 
 
276 aa  204  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.407499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  42.03 
 
 
285 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  40.59 
 
 
281 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  40.59 
 
 
281 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  40.59 
 
 
281 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  40.07 
 
 
281 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  41.52 
 
 
285 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  39.71 
 
 
281 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  37.78 
 
 
279 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  40.49 
 
 
285 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  34.78 
 
 
295 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  40.6 
 
 
302 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  38.01 
 
 
280 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  39.86 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  40.59 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  37.1 
 
 
280 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  39.35 
 
 
281 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  39.35 
 
 
281 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  39.49 
 
 
281 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  40.22 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.341276 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>