155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0579 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0365448  normal  0.281222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0872  hypothetical protein  64.59 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2013  hypothetical protein  63.42 
 
 		 260 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0102184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0369  hypothetical protein  63.42 
 
 		 260 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0475  hypothetical protein  62.79 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  47.43 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  40.16 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  39.68 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  40.08 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  39.68 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  40.08 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  41.8 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  40.08 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  40.08 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  40.48 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  40.87 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  40.08 
 
 		 280 aa  178  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  40.08 
 
 		 280 aa  178  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  40.08 
 
 		 280 aa  178  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  40.48 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  39.29 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  40.08 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  40.48 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  40.48 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  38.28 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  38.28 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  39.29 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  38.89 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  39.29 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  39.29 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  39.84 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  37.98 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  42.35 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  38.22 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  39.76 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  37.98 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  37.25 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0292  hypothetical protein  36.8 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.866126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  36.82 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  39.77 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  36.82 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  33.82 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  41.48 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  40.23 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  40.23 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  40.23 
 
 		 281 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  37.65 
 
 		 279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2832  hypothetical protein  40.62 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  35.66 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  40.23 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  39.53 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  39.92 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  38.72 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  37.4 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  39.45 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  39.45 
 
 		 281 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  40.93 
 
 		 282 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01957  hypothetical protein  35.93 
 
 		 292 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  38.17 
 
 		 285 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  38.22 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  39.45 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  40.23 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  41.47 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  39.29 
 
 		 280 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  37.98 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  39.84 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  38.02 
 
 		 285 aa  158  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  38.43 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  38.37 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  37.89 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  38.37 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  38.37 
 
 		 301 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  37.65 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  37.69 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  37.98 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  38.31 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  37.31 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  37.98 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  38.82 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  36.33 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  37.4 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  38.6 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  36.12 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  37.07 
 
 		 280 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  38.2 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  39.22 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  37.6 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  35.11 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3310  hypothetical protein  39.53 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  37.74 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  39.61 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  35.8 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  36.12 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  39.85 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  37.12 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  37.74 
 
 		 281 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  37.84 
 
 		 281 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  38.85 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  37.02 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  35.85 
 
 		 293 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>