155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0458 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  85.97 
 
 		 278 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  85.61 
 
 		 278 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  76.62 
 
 		 278 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  76.62 
 
 		 278 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  78.42 
 
 		 278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  75.9 
 
 		 300 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  76.98 
 
 		 278 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  69.06 
 
 		 278 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  69.06 
 
 		 278 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  70.97 
 
 		 282 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  43.01 
 
 		 280 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  43.01 
 
 		 280 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  43.01 
 
 		 280 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  43.01 
 
 		 280 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  43.73 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  43.73 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  43.73 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  43.73 
 
 		 280 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  42.65 
 
 		 280 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  43.73 
 
 		 280 aa  249  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  43.73 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  43.73 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  43.73 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  43.73 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  42.29 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  39.21 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  41.58 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  41.94 
 
 		 280 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  41.94 
 
 		 280 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  38.85 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  42.97 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  42.29 
 
 		 280 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  41.58 
 
 		 280 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  42.59 
 
 		 280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  40.36 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  40.86 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  43.4 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  42.86 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  45.9 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  45 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  45.15 
 
 		 286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  40.86 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  38.13 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  43.06 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  43.46 
 
 		 290 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  36.69 
 
 		 279 aa  225  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  43.97 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  41.97 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  43.87 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  37.28 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  41.85 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  38.93 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  39.64 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  40.21 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  40.21 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  40.21 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  40.96 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  39.78 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  39.93 
 
 		 285 aa  211  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  42.65 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  44.12 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  38.21 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  42.32 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  41.57 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  42.29 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  38.21 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  41.76 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  41.05 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.141291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  39.85 
 
 		 308 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  42.44 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  38.71 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  37.14 
 
 		 281 aa  205  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  40.94 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  42.76 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  40 
 
 		 285 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  39.64 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  42.24 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  39.11 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  38.75 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  38.75 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  39.11 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  36.56 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  39.11 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  38.75 
 
 		 301 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  37.63 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  38.52 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  38.75 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  36.69 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  40.81 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  38.38 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  39.11 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  41.18 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  45.04 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  38.01 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  37.14 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  39.1 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  42.07 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  38.38 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  38.38 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>