154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4679 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4679  protein of unknown function DUF519  100 
 
 		 320 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0720  hypothetical protein  68.85 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.802576  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  67.91 
 
 		 299 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0602  protein of unknown function DUF519  65.94 
 
 		 296 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4114  hypothetical protein  63.25 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0623  hypothetical protein  65.94 
 
 		 296 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5915  hypothetical protein  64.6 
 
 		 290 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1788  hypothetical protein  64.06 
 
 		 293 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0496  hypothetical protein  59.41 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  45.51 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  45.6 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  44.69 
 
 		 285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  44.34 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  44.65 
 
 		 285 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  44.97 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  43.12 
 
 		 281 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  43.08 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1063  hypothetical protein  42.19 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0632007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  41.25 
 
 		 281 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  41.3 
 
 		 304 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5863  hypothetical protein  41.25 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2214  hypothetical protein  41.25 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  41.64 
 
 		 281 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1806  hypothetical protein  41.01 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000978689 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  41.64 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  40.94 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  41.32 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  41.64 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2252  hypothetical protein  41.56 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  46.1 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  41.32 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2131  hypothetical protein  41.25 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.553822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  41.88 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  42.19 
 
 		 281 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0020  hypothetical protein  41.01 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  42.06 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  41.32 
 
 		 281 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  39.41 
 
 		 280 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  39.41 
 
 		 280 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  39.41 
 
 		 280 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  39.41 
 
 		 280 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  39.41 
 
 		 280 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  40.39 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  40.07 
 
 		 280 aa  208  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  39.09 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  39.74 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  39.74 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  39.74 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  39.74 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  39.41 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  39.07 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  34.58 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  35.53 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  39.41 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  39.41 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  39.41 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  39.41 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  39.41 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  39.41 
 
 		 280 aa  203  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  37.46 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  37.54 
 
 		 281 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  37.66 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  37.46 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  34.81 
 
 		 280 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  38.11 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  37.03 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  39.62 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  35.96 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  34.85 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  35.5 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  35.56 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  38.34 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  34.74 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  37.5 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  36.59 
 
 		 284 aa  189  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  37.7 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  37.66 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  34.2 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  35 
 
 		 281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  34.16 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  36.91 
 
 		 282 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  33.96 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  34.69 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  33.23 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  33.88 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  33.23 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  33.23 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  34.69 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  35.46 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  36.08 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  32.92 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  35.13 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  33.75 
 
 		 281 aa  175  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  35.44 
 
 		 289 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  32.8 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  35.44 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  32.25 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  37.79 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  34.81 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  34.81 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>