More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6178 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6178  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
204 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203185  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  49.24 
 
 
207 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
203 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 
205 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  36.65 
 
 
205 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.64 
 
 
205 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.26 
 
 
203 aa  101  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 
203 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  32.6 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.66 
 
 
230 aa  98.2  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  35.47 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  41.57 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  40.23 
 
 
210 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  40.46 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.18 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  41.01 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  41.01 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 
206 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  37.19 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.57 
 
 
216 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.43 
 
 
209 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  37.11 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  34.47 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  36.81 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  29.13 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.88 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  32.21 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  34 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.51 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.42 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.58 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.47 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  39.34 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  39.34 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  39.34 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  39.34 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  28.11 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  39.34 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  39.34 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  27 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  39.34 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.47 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  34.25 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.81 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  34.15 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  28.96 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.89 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  28.96 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  28.96 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  39.2 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.5 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  26.83 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.98 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.02 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  26.92 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.61 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.95 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  28.5 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  28.5 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.5 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.5 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.5 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  28.77 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  28.5 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.5 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.05 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>