More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2012 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2012  gamma-aminobutyrate permease related permease  100 
 
 		 449 aa  880    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0171181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0868  amino acid permease  43.97 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  34.64 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  32.31 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1458  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4407  amino acid ABC transporter permease  33.62 
 
 		 460 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0417319 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  35.62 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 		 462 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  38.4 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.19 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1447  amino acid permease-associated region  33.19 
 
 		 460 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  33.84 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  38.12 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  32.66 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  32.66 
 
 		 463 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  35.42 
 
 		 459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  33.68 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  33.68 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  32.44 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  32.84 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25270  aromatic amino acid transport protein AroP1  38.69 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  33.04 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  33.68 
 
 		 473 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  33.04 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  33.68 
 
 		 473 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  33.04 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  33.47 
 
 		 473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3973  amino acid permease-associated region  32.75 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  36.74 
 
 		 466 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  32.22 
 
 		 456 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  32.22 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  32.22 
 
 		 456 aa  223  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  32.22 
 
 		 456 aa  223  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  32.22 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  32.22 
 
 		 456 aa  223  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  32.22 
 
 		 456 aa  223  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  37.19 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  32.36 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  32.36 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  32.36 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  32.36 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  33.76 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  32.36 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  33.09 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  35.73 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  35.73 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  31.82 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  33.26 
 
 		 473 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  35.48 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  35.48 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  35.48 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  35.48 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  35.08 
 
 		 467 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  33.02 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  35.81 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0786  amino acid tranporter  33.33 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  33.26 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0458  amino acid permease-associated region  33.86 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  33.16 
 
 		 468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  32.61 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  35.9 
 
 		 472 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3372  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  35.9 
 
 		 472 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  32.91 
 
 		 467 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1517  gamma-aminobutyrate permease  32.45 
 
 		 507 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0163  aromatic amino acid transporter  35.81 
 
 		 456 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  33.16 
 
 		 467 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0168  aromatic amino acid transporter  35.81 
 
 		 456 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0171  aromatic amino acid transporter  35.81 
 
 		 456 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0164  aromatic amino acid transporter  35.81 
 
 		 456 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  32.75 
 
 		 467 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  32.09 
 
 		 473 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0632  amino acid permease-associated region  37.85 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5379  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 459 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0243202  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  33.61 
 
 		 468 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  33.55 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  34.69 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  35.29 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  33.33 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  35.64 
 
 		 472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1493  amino acid permease-associated region  34.55 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  33.71 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  34.69 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  35.47 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  32.65 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  33.59 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  31.63 
 
 		 463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4502  amino acid permease-associated region  35.66 
 
 		 461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1594  aromatic amino acid transport protein  33.05 
 
 		 461 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  36.51 
 
 		 469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0307  GABA permease  34.5 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  33.9 
 
 		 469 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>