More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0868 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0868  amino acid permease  100 
 
 		 446 aa  885    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2012  gamma-aminobutyrate permease related permease  43.97 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0171181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1458  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 		 461 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.5 
 
 		 463 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  33.33 
 
 		 461 aa  269  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  33.07 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  33.07 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  32.8 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  32.8 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  32.8 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  32.54 
 
 		 485 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  33.33 
 
 		 457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  33.33 
 
 		 457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5252  amino acid permease-associated region  34 
 
 		 443 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.38319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  35.61 
 
 		 463 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  31.86 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  31.86 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  31.86 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  33.11 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  31.86 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  35.79 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  35.79 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 463 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  35.53 
 
 		 463 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 463 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  32.98 
 
 		 459 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3372  amino acid permease-associated region  36.29 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  33.42 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  37.09 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  34.29 
 
 		 462 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0905  amino acid permease-associated region  37.04 
 
 		 460 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  33.68 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0834  amino acid permease-associated region  36.77 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  35.7 
 
 		 467 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 		 455 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  33.42 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  35.34 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0732  amino acid permease-associated region  35.22 
 
 		 455 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1212  amino acid permease-associated region  35.22 
 
 		 455 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  35.77 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  35.08 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  36.91 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  34.82 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  32.89 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  32.89 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  31.86 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  35.55 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  32.89 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  36.41 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1185  amino acid permease-associated region  34.96 
 
 		 455 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199623  normal  0.379883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  35.25 
 
 		 467 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  34.39 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  32.63 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  32.63 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  32.63 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  32.63 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 		 472 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  34.93 
 
 		 472 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  34.93 
 
 		 472 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1887  amino acid permease-associated region  34.93 
 
 		 466 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  35.08 
 
 		 473 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  35.36 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2910  putative proline-specific permease  35.4 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  34.13 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  35.53 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  33.84 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3132  putative proline-specific permease  34.5 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4320  amino acid transporter  34.45 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.619853  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  35.39 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3272  putative proline-specific permease  34.5 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  32.92 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  31.96 
 
 		 459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  32.92 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  33.33 
 
 		 461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  31.4 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  32.92 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  32.92 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  32.23 
 
 		 476 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  32.1 
 
 		 476 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1516  amino acid permease  34.39 
 
 		 454 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1385  amino acid transporter  34.39 
 
 		 454 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  32.1 
 
 		 476 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3282  putative proline-specific permease  34.28 
 
 		 463 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0197243 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  32.1 
 
 		 476 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3297  putative proline-specific permease  33.77 
 
 		 458 aa  239  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  32.67 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  32.67 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1013  putative proline-specific permease  36.07 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1774  amino acid permease  34.13 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1185  amino acid transporter  34.13 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0685  amino acid transporter  34.13 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0485493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1381  amino acid transporter  34.13 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.568485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>