More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1817 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1417  amino acid permease-associated region  84.6 
 
 		 472 aa  800    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4495  amino acid ABC transporter permease  84.82 
 
 		 472 aa  800    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4001  amino acid permease-associated region  83.33 
 
 		 467 aa  789    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070597  hitchhiker  0.0000638701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2159  aromatic amino acid transport protein AroP1  79.06 
 
 		 469 aa  701    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  100 
 
 		 469 aa  942    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4651  aromatic amino acid transport protein AroP2  83.33 
 
 		 472 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3580  amino acid permease-associated region  97.87 
 
 		 469 aa  924    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.90045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3784  amino acid permease-associated region  84.48 
 
 		 473 aa  804    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000046446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1493  amino acid permease-associated region  88.89 
 
 		 472 aa  841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25270  aromatic amino acid transport protein AroP1  79.51 
 
 		 469 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53050  aromatic amino acid transport protein AroP2  83.11 
 
 		 472 aa  780    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  66.09 
 
 		 457 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  66.96 
 
 		 456 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  66.96 
 
 		 456 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  66.08 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  66.08 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  66.96 
 
 		 456 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  66.08 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  66.09 
 
 		 457 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  66.59 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  66.1 
 
 		 460 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  66.96 
 
 		 456 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  66.74 
 
 		 455 aa  611  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0632  amino acid permease-associated region  67.48 
 
 		 448 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  66.96 
 
 		 456 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  65.3 
 
 		 456 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  66.96 
 
 		 456 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  66 
 
 		 466 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  66.74 
 
 		 456 aa  609  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3570  amino acid permease-associated region  65.58 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  65.93 
 
 		 461 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1887  amino acid permease-associated region  64.92 
 
 		 466 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  65.86 
 
 		 456 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0163  aromatic amino acid transporter  65.86 
 
 		 456 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0171  aromatic amino acid transporter  65.86 
 
 		 456 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0168  aromatic amino acid transporter  65.86 
 
 		 456 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0164  aromatic amino acid transporter  65.86 
 
 		 456 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3756  amino acid permease-associated region  65.14 
 
 		 452 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0213954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0671  amino acid permease-associated region  65.79 
 
 		 453 aa  598  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  63.97 
 
 		 461 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0705  amino acid permease-associated region  64.84 
 
 		 457 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2179  amino acid permease-associated region  64.84 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0341805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3494  amino acid permease-associated region  65.66 
 
 		 465 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3366  aromatic amino acid transport protein AroP  67.04 
 
 		 465 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0519215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0933  amino acid permease-associated region  62.61 
 
 		 452 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1037  aromatic amino acid transporter  67.04 
 
 		 465 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.725191  normal  0.852119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0927  amino acid ABC transporter permease  62.39 
 
 		 453 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4502  amino acid permease-associated region  64.32 
 
 		 461 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  62.25 
 
 		 462 aa  581  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0967  amino acid permease-associated region  62.39 
 
 		 453 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695825  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4288  amino acid permease-associated region  61.74 
 
 		 451 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  61.54 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  61.54 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  61.54 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  61.54 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  61.54 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  61.54 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4269  amino acid permease-associated region  64 
 
 		 461 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1594  aromatic amino acid transport protein  61.54 
 
 		 461 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1671  amino acid transporter  63.36 
 
 		 461 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0584756  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4018  amino acid permease-associated region  62.91 
 
 		 461 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4349  amino acid permease-associated region  62.91 
 
 		 461 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6005  amino acid permease-associated region  62.91 
 
 		 461 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.44513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  57.05 
 
 		 470 aa  551  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  57.05 
 
 		 470 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4796  amino acid permease-associated region  59.74 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0905824  normal  0.72838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  56.83 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  56.83 
 
 		 470 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  57.05 
 
 		 458 aa  551  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  57.05 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4232  amino acid permease-associated region  62.44 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  57.05 
 
 		 458 aa  551  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3758  amino acid permease-associated region  62.67 
 
 		 461 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.230663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  56.74 
 
 		 462 aa  551  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  56.83 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  57.05 
 
 		 458 aa  548  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  57.56 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0552  amino acid permease-associated region  60.67 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  57.56 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  57.33 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  57.33 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  57.56 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0642  amino acid permease-associated region  59.6 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3147  amino acid permease-associated region  55.6 
 
 		 474 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  53.5 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  52.43 
 
 		 452 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1513  gamma-aminobutyrate permease  46.4 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  45.89 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  45.59 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  45.61 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  46.87 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  45.61 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  45.45 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  45.61 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  45.02 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 		 475 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  45.95 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  45.03 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  46.99 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  44.95 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>