More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1830 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1830  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  687    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  48.12 
 
 
378 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  48.68 
 
 
382 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
402 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.52 
 
 
415 aa  106  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  21.12 
 
 
392 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
411 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
399 aa  86.3  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.97 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.97 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  24.21 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.96 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  18.97 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.84 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  28.03 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.14 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  22.01 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  22.29 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  21.05 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  22.3 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
433 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
388 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
379 aa  62.8  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 
400 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  25.47 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  28.57 
 
 
389 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
353 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
904 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  20.16 
 
 
372 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  24.59 
 
 
429 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  21.03 
 
 
393 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
429 aa  59.7  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
365 aa  59.7  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.6 
 
 
346 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
374 aa  59.7  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.08 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.07 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1156  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.656531 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  22.54 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  21.96 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  19.86 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
413 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.26 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
411 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
773 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
456 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1760  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
428 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  29.88 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
453 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
394 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>