130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1621 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1621  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 232 aa  85.1  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.12 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  30.73 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  31.18 
 
 		 281 aa  64.7  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  32.56 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 411 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.88 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  29.52 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  31.51 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.52 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.05 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  28.39 
 
 		 366 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.92 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  32.39 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.87 
 
 		 365 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.87 
 
 		 365 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.87 
 
 		 365 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 226 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 226 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 226 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  30.15 
 
 		 438 aa  50.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  34.45 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 412 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.03 
 
 		 378 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  28.67 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.22 
 
 		 382 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.45 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  28.3 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.32 
 
 		 378 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  33.93 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  33.93 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  37.04 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  37.04 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.93 
 
 		 442 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 363 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 224 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.14 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.14 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  28.97 
 
 		 229 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 232 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  24.69 
 
 		 378 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.14 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2044  phosphatase PhoE  32.14 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.21 
 
 		 442 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.3 
 
 		 356 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 228 aa  44.7  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 244 aa  44.7  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  36 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.55 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.39 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.42 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.39 
 
 		 452 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.14 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  27.34 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>