169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3517 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3517  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  100 
 
 
386 aa  791    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227443 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3220  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  67.07 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00317601  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0634  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
340 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2216  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.36837  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0971  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.33 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000651502  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0933  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.33 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329289  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3441  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.4 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.837811  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0935  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.75 
 
 
370 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113128  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3209  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.35 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.586905  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1100  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3369  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.69 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2077  TRAP dicarboxylate transporter subunit DctP  30.13 
 
 
322 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.18454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0937  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.49 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.592464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3566  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.33 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.123987  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0921  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.33 
 
 
400 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2456  Extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
337 aa  63.2  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1572  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.28 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3284  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.51 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.970201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3546  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.57 
 
 
323 aa  59.7  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4441  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.53 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.135169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2113  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.79 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2874  twin-arginine translocation pathway signal  25.36 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0243  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  28 
 
 
334 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2055  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2011  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.34 
 
 
366 aa  57.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0290842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3477  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.38 
 
 
358 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0345  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1708  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.76 
 
 
334 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0946  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.1 
 
 
374 aa  57  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3285  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.2 
 
 
360 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4720  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.42 
 
 
364 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.607383  normal  0.0697574 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3150  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.9 
 
 
359 aa  56.6  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.117485  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1502  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.29 
 
 
360 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4440  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.48 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.270003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0671  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.9 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2244  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.56 
 
 
359 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342958  normal  0.0290816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3543  twin-arginine translocation pathway signal  22.48 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568783  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2003  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.3 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00153551  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3258  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.28 
 
 
333 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.0638334 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0910  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  27.34 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0446  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.05 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00272496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4436  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.66 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0570  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.32 
 
 
338 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2569  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  27.34 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282286  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4514  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.64 
 
 
364 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3427  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.1 
 
 
328 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3619  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3396  twin-arginine translocation pathway signal  22.48 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2032  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.18 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3790  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.81 
 
 
326 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3153  TRAP transporter - DctP subunit  26.67 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1750  twin-arginine translocation pathway signal  23.27 
 
 
359 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0609  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.63 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0034  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.6 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2873  twin-arginine translocation pathway signal  25.31 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2292  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.6 
 
 
357 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1941  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.19 
 
 
355 aa  53.1  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.44609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2882  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.45 
 
 
357 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000710816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0129  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5036  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.56 
 
 
341 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2784  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.98 
 
 
331 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003132  TRAP transporter solute receptor  22.09 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000514187  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3453  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  23.5 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1291  twin-arginine translocation pathway signal  23.19 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.881073  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3157  TRAP transporter - DctP subunit  27.1 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3098  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.5 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.528068 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4505  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.68 
 
 
338 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3747  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.78 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.706849  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0361  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.908183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2260  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.79 
 
 
334 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0772671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6043  TRAP-Type C4-dicarboxylate transport system, binding periplasmic protein (DctP subunit)  23.51 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302858  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1224  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.4 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1026  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.02 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.608774  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0878  twin-arginine translocation pathway signal  25.08 
 
 
361 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3328  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.43 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0914439  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3467  putative periplasmic mannitol-binding protein  22.3 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1319  C4-dicarboxylate transport system, C4-dicarboxylate-binding protein  22.71 
 
 
356 aa  50.8  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000340401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2659  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.33 
 
 
336 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0557  Extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
324 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2044  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.41 
 
 
327 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3338  hypothetical protein  22.41 
 
 
358 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0449  Extracellular solute-binding protein, family 7  24.04 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145503  normal  0.0293677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4515  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.27 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0892  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000149436  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2164  transporter, periplasmic component  26.01 
 
 
356 aa  49.7  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0458836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2243  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.15 
 
 
360 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273001  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0883  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.92 
 
 
364 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550638  hitchhiker  0.00000307081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2569  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.9 
 
 
341 aa  49.7  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2829  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.74 
 
 
353 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1404  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5228  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.73 
 
 
346 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2049  twin-arginine translocation pathway signal  24.06 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3214  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.82 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1554  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.93 
 
 
360 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2542  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, periplasmic component  23.81 
 
 
363 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3750  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  20.32 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.871351 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3131  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.38 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0331  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1576  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.36 
 
 
336 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1558  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.17 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>