133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6390 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6390  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 497 aa  983    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 571 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  30.28 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.71 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  31.72 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  32.47 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 589 aa  66.6  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  26.43 
 
 		 566 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 570 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  29.53 
 
 		 573 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  28 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  34.04 
 
 		 564 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 567 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.46 
 
 		 568 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  28.47 
 
 		 387 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.17 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2457  type II secretion system protein E  31.39 
 
 		 623 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.17 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  24.62 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25 
 
 		 571 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.76 
 
 		 568 aa  60.1  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  28.06 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  27.97 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  28.5 
 
 		 568 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  27.97 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  24.34 
 
 		 787 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  27.14 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  27.08 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  27.27 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  28.86 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  27.14 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.23 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  27.59 
 
 		 871 aa  57.4  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  26.53 
 
 		 559 aa  57  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  26.06 
 
 		 568 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  26.87 
 
 		 385 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  31.21 
 
 		 841 aa  56.6  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  30.28 
 
 		 552 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  27.97 
 
 		 577 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  27.08 
 
 		 370 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  26.43 
 
 		 568 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 561 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  26.06 
 
 		 568 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  27.27 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.71 
 
 		 568 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.43 
 
 		 568 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.43 
 
 		 568 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  25.87 
 
 		 574 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  37.08 
 
 		 570 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  29.45 
 
 		 378 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  25 
 
 		 577 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 566 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  30.99 
 
 		 688 aa  53.9  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  31.21 
 
 		 557 aa  53.5  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  27.54 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 885 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 572 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  25.68 
 
 		 275 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  31.93 
 
 		 587 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  27.69 
 
 		 594 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  28.24 
 
 		 561 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  25.5 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  32.84 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  32.28 
 
 		 553 aa  51.2  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  24.65 
 
 		 561 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 567 aa  50.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  31.01 
 
 		 1017 aa  50.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  27.27 
 
 		 571 aa  50.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  29.29 
 
 		 550 aa  50.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  31.3 
 
 		 574 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  30.53 
 
 		 181 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  32.81 
 
 		 575 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  25 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  27.54 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.17 
 
 		 703 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  29.5 
 
 		 182 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  26.92 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 573 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3615  general secretion pathway protein E  28.57 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 586 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  25 
 
 		 280 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  25.15 
 
 		 555 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  32.17 
 
 		 703 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  30.53 
 
 		 181 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  31.3 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  25 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 599 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 585 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0972  type II secretion system protein E  24.82 
 
 		 528 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  30 
 
 		 582 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  28.48 
 
 		 586 aa  47.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  30.25 
 
 		 577 aa  47.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  39.77 
 
 		 745 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  26.43 
 
 		 891 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  29.08 
 
 		 574 aa  47.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.77 
 
 		 745 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.77 
 
 		 745 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>