More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3845 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  599  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  49.83 
 
 		 334 aa  295  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  49.66 
 
 		 298 aa  292  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  48.15 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  48.15 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  47.81 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  46.98 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  46.53 
 
 		 304 aa  268  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  45.3 
 
 		 385 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  41.67 
 
 		 287 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  45.27 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  43.79 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  41.32 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  45.27 
 
 		 365 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  46.51 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  43.16 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  41.72 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  41.52 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  42.47 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  37.8 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  40.35 
 
 		 293 aa  217  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  41.55 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  41.41 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  43.25 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  39.72 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  35.74 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  35.81 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  26.75 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.69 
 
 		 713 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.69 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.69 
 
 		 713 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.13 
 
 		 712 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.13 
 
 		 711 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32 
 
 		 708 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.56 
 
 		 711 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.33 
 
 		 711 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  29.86 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  30.1 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.03 
 
 		 701 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.33 
 
 		 709 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.39 
 
 		 713 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.05 
 
 		 709 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.05 
 
 		 709 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  28.72 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.83 
 
 		 709 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.83 
 
 		 709 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  35.94 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.19 
 
 		 711 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  40 
 
 		 560 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  30.25 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  30.71 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.25 
 
 		 711 aa  68.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  28.23 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.93 
 
 		 711 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.2 
 
 		 708 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  30.38 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  30.37 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.89 
 
 		 699 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.55 
 
 		 711 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  29.75 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  28.93 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.86 
 
 		 712 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  28.93 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.3 
 
 		 725 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  37.08 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  26.4 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  30.26 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  32 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  37.12 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  31.2 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  30.59 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  31.48 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  31.48 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  28 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  33.88 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24675  hypothetical protein  27.85 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.58 
 
 		 722 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  31.48 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  31.48 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  31.48 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  29.93 
 
 		 839 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  29.77 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  31.48 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  31.48 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  31.48 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  31.48 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.9 
 
 		 706 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  29.91 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  35.96 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  35.96 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  35.96 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  35.96 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  33.83 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  32.59 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  30 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  25.49 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.06 
 
 		 730 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>