More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0277 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  604  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  76.92 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  61.17 
 
 		 291 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  55.63 
 
 		 311 aa  320  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  53.08 
 
 		 290 aa  316  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  41.81 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  41.32 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  45.26 
 
 		 287 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  39.58 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  41.55 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  38.33 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  40.47 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  39.19 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  39.44 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  38.8 
 
 		 386 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  39.46 
 
 		 381 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  40.28 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  39.33 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  38.74 
 
 		 381 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  38.28 
 
 		 294 aa  208  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  38.95 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  40 
 
 		 405 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  38.95 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  40.42 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  35.82 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  38.02 
 
 		 252 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  27.82 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  30.05 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  30.16 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  33.8 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  30.05 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  31.33 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  28.85 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  30.41 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  26.97 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.9 
 
 		 712 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.82 
 
 		 807 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  28.02 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.61 
 
 		 711 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.84 
 
 		 776 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  33.11 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.84 
 
 		 768 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.11 
 
 		 709 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.11 
 
 		 709 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  33.11 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  28.42 
 
 		 408 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  31.21 
 
 		 560 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.3 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.3 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.3 
 
 		 713 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.49 
 
 		 711 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  27.54 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  25.55 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  25.55 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  32.09 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  30.41 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.47 
 
 		 709 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.47 
 
 		 709 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  32.06 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.66 
 
 		 709 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.68 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.92 
 
 		 701 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  23.05 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.62 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4829  putative RNA methylase  26.44 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  28.66 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  35.11 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  30.27 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.4 
 
 		 708 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 396 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  33.08 
 
 		 389 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  28.12 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.8 
 
 		 712 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  31.78 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  31.33 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  30.07 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  36.43 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.87 
 
 		 711 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  28.74 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.34 
 
 		 738 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.82 
 
 		 711 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  29.61 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.45 
 
 		 711 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  30.07 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  32.17 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  33.08 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.56 
 
 		 707 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  26.95 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  27.09 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.63 
 
 		 711 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  27.69 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.86 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  30.08 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  28.96 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24675  hypothetical protein  25.41 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.45 
 
 		 711 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  29.73 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  35.43 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  29.32 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>