243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0922 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  65.61 
 
 		 288 aa  371  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  70.24 
 
 		 252 aa  348  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  51.71 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  47.1 
 
 		 298 aa  265  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  47.14 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  44.59 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  44.78 
 
 		 386 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  44.26 
 
 		 381 aa  245  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  47.12 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  43.16 
 
 		 291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  45.08 
 
 		 385 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  46.82 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  46.78 
 
 		 365 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  42.41 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  39.86 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  42 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  38.28 
 
 		 291 aa  208  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  36.18 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  37.04 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  37.25 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  39.04 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  35.03 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  33.93 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  36.27 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  33.57 
 
 		 560 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  33.77 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  33.1 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  32.76 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  33.87 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.67 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  35.83 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.3 
 
 		 709 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.3 
 
 		 709 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  26.38 
 
 		 390 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  26.38 
 
 		 390 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  30.71 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  30.83 
 
 		 400 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  32.22 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  29.93 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  37.08 
 
 		 400 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  37.08 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  29.77 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  37.08 
 
 		 400 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  33.06 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  35.71 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  39.76 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  33.06 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  29.2 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  32.43 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  28.72 
 
 		 657 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  35.71 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.59 
 
 		 711 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  33.6 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  31.75 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2658  hypothetical protein  26.55 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  33.06 
 
 		 400 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.3 
 
 		 709 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.85 
 
 		 722 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.3 
 
 		 709 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  38.2 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  30.77 
 
 		 400 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  28.21 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  40 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  32.8 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  40 
 
 		 423 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  28.91 
 
 		 395 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  28.93 
 
 		 396 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  40 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  40 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  40 
 
 		 422 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  40 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  40 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  32.8 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  30.84 
 
 		 390 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  27.89 
 
 		 400 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  32.8 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  32.8 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  31.37 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.63 
 
 		 711 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.56 
 
 		 713 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.56 
 
 		 713 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  28.23 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.8 
 
 		 713 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  31.88 
 
 		 396 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  28.85 
 
 		 320 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.67 
 
 		 701 aa  52.8  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.25 
 
 		 708 aa  52.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  42.86 
 
 		 389 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  39.29 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  27.03 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  27.03 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  34.12 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  28.99 
 
 		 433 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  34.12 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  27.06 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.24 
 
 		 712 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  24.88 
 
 		 839 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>