More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0743 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  100 
 
 		 293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  59.18 
 
 		 297 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  60.27 
 
 		 295 aa  359  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  56.46 
 
 		 293 aa  349  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  41.87 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  38.85 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  41.41 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  39.66 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  40.42 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  42.66 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  41.75 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  41.98 
 
 		 386 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  39.31 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  41.64 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  41.64 
 
 		 381 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  39.8 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.15 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  37.04 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  38.93 
 
 		 385 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  37.62 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  41.91 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  41.91 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  40.73 
 
 		 405 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  39 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  35.31 
 
 		 275 aa  179  7e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  38.11 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  31.76 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  31.93 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  27.4 
 
 		 560 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.61 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  28.49 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  32.16 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  31.61 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  32.59 
 
 		 839 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  26.89 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  28.95 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  25.58 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  28.95 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  28.95 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  29.37 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30 
 
 		 713 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  28.95 
 
 		 404 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.21 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  31.58 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0286  SAM-dependent methyltransferase  30.83 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0617  methyltransferase related protein  31.15 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  30.87 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  28.95 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  35.29 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  28.29 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  35.48 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.28 
 
 		 711 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1367  protein of unknown function Met10  30 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0552  methyltransferase small  30 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  27.61 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  27.63 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  33.04 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  26.97 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  33.04 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  30.82 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  33.04 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  32 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28 
 
 		 713 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  32 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28 
 
 		 713 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  34.15 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  32 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28 
 
 		 713 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  32 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  31.97 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  31.29 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  27.61 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  40.74 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  40.74 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  40.74 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  40.74 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  40.74 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  40.74 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  40.74 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  40.74 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.85 
 
 		 722 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  32 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  32 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  32 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  32 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  31.97 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.19 
 
 		 711 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  31.97 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  26.09 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  30.58 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>