More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2221 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  100 
 
 		 297 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  59.18 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  63.23 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  52.2 
 
 		 293 aa  329  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  42.52 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  41.72 
 
 		 291 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  40.8 
 
 		 287 aa  222  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  40.13 
 
 		 290 aa  221  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  40.47 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  42.55 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  41.12 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  42.86 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  42.36 
 
 		 381 aa  208  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  42.01 
 
 		 381 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  42.28 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  41.89 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  43.7 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  41.1 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.12 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  42.91 
 
 		 405 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  37.72 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  41.61 
 
 		 365 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  41.24 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  38.19 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  40.1 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  30.38 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  28.82 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  28.41 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  33.09 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  32.2 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  30.6 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  31.34 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  26.61 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.61 
 
 		 715 aa  62.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  28.67 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0552  methyltransferase small  27.61 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0617  methyltransferase related protein  30 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0286  SAM-dependent methyltransferase  27.61 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  30.43 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1367  protein of unknown function Met10  27.61 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  29.87 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  35.2 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  27.89 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  30.67 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  30.88 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  29.22 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  29.22 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  25.65 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  29.22 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  30.88 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  32.88 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  27.23 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  29.19 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  29.22 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  30.82 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  29.22 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.41 
 
 		 712 aa  59.3  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  35.14 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.74 
 
 		 713 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.36 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  35.14 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  35.14 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  35.14 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  35.14 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  32.8 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  35.14 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  35.14 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  35.14 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.6 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.6 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  30 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.6 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  28.1 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  26.54 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  31.38 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  30.08 
 
 		 400 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  28 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.73 
 
 		 711 aa  56.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  27.39 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  28.99 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  27.74 
 
 		 367 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  30 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  27.74 
 
 		 367 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  28.46 
 
 		 403 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.21 
 
 		 709 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.45 
 
 		 479 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  30.95 
 
 		 560 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.78 
 
 		 701 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.21 
 
 		 709 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  27.74 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  27.74 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.68 
 
 		 725 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  27.74 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.21 
 
 		 709 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  27.74 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  27.74 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  28.36 
 
 		 395 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  27.74 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>