293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3463 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  100 
 
 		 293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  55.86 
 
 		 295 aa  329  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  52.2 
 
 		 297 aa  329  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  56.46 
 
 		 293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  41.44 
 
 		 287 aa  242  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  39.19 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  40.35 
 
 		 291 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  39.19 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  41.16 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  38.18 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  41.92 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  41.45 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  40.89 
 
 		 385 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  40.79 
 
 		 381 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  40.94 
 
 		 381 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  41.54 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  38.11 
 
 		 334 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  36.82 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  35.03 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.99 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  40.15 
 
 		 365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  40.15 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  35.49 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  37.19 
 
 		 275 aa  179  7e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  40 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  33.46 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  28.77 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.11 
 
 		 712 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  39.09 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  30.83 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  30.95 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  28.66 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  38.89 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.32 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.32 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.09 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  31.25 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  41.46 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0552  methyltransferase small  32.69 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0286  SAM-dependent methyltransferase  32.69 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.09 
 
 		 701 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  28.1 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0617  methyltransferase related protein  33.65 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.72 
 
 		 713 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.08 
 
 		 738 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.81 
 
 		 709 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1367  protein of unknown function Met10  31.73 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  28.77 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  26.67 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.61 
 
 		 711 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.34 
 
 		 711 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  33.06 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  30.26 
 
 		 395 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  26.67 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  26.67 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  26.67 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  26.67 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  34.58 
 
 		 412 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  26.67 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  26.67 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  38.27 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  29.1 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  38.27 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  25.47 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  26.67 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  26.67 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  26.67 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  26.14 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  26.14 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  26.14 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.1 
 
 		 709 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.1 
 
 		 709 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  26.14 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1312  THUMP domain protein  28.67 
 
 		 768 aa  55.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530559  normal  0.0438625 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  26.14 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  26.14 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  26.14 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.5 
 
 		 713 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  26.14 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  26.14 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.57 
 
 		 708 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.46 
 
 		 709 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.46 
 
 		 709 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  38.55 
 
 		 493 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  32.11 
 
 		 839 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.04 
 
 		 715 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.27 
 
 		 711 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  30.88 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  31.62 
 
 		 394 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  30.19 
 
 		 394 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  26.4 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  32.08 
 
 		 394 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.58 
 
 		 722 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  30.88 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  26.35 
 
 		 413 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.61 
 
 		 699 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.25 
 
 		 711 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.21 
 
 		 711 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  29.08 
 
 		 392 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>