More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1219 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  100 
 
 		 295 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  63.23 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  60.27 
 
 		 293 aa  359  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  55.86 
 
 		 293 aa  338  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  40.13 
 
 		 298 aa  238  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  40.67 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  43.54 
 
 		 334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  42 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  42 
 
 		 381 aa  229  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  42.67 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  41.55 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  39.33 
 
 		 291 aa  221  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  41.47 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  38.72 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  39 
 
 		 385 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  40.54 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  39.04 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  40 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.46 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  40.21 
 
 		 365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  39.86 
 
 		 365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  39.12 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  38.91 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  36.05 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  36.59 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  28.5 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  26.43 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  30 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  30.12 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  27.78 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  25.51 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  27.22 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  29 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.97 
 
 		 712 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  34.68 
 
 		 560 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.1 
 
 		 713 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  35.79 
 
 		 408 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0552  methyltransferase small  30.6 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0286  SAM-dependent methyltransferase  27.75 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  36.59 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  33.08 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  29.14 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  29.14 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  29.14 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  29.14 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  31.43 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1367  protein of unknown function Met10  30.6 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  29.5 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  37.23 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.6 
 
 		 711 aa  58.9  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  29.41 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  27.81 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  27.81 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  29.41 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  32.63 
 
 		 400 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  34.17 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  27.81 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  27.67 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  32.63 
 
 		 400 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  34.17 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  32.63 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  33.94 
 
 		 839 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  27.81 
 
 		 425 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  27.81 
 
 		 425 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  27.81 
 
 		 425 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  27.81 
 
 		 425 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  27.81 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.94 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.94 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  27.81 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.94 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.94 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  27.81 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  27.63 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  27.15 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  27.15 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  26.97 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.17 
 
 		 701 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  28.44 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  34.17 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  34.17 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  34.17 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  35.79 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.03 
 
 		 711 aa  55.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  35.78 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  26.57 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0617  methyltransferase related protein  32.05 
 
 		 381 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  29.84 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  29.08 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  27.27 
 
 		 411 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  27.97 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.95 
 
 		 713 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.95 
 
 		 713 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.95 
 
 		 713 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  29.41 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.03 
 
 		 711 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  28.26 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  33.04 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>