More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0151 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  100 
 
 
381 aa  780    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  98.95 
 
 
381 aa  770    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  89.49 
 
 
386 aa  685    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  73.35 
 
 
334 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  66.46 
 
 
314 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  60.95 
 
 
385 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  60.99 
 
 
365 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  66.88 
 
 
365 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  59.79 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  52.35 
 
 
304 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  47.81 
 
 
291 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  47.2 
 
 
298 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  45.39 
 
 
288 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  44.26 
 
 
294 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  46.51 
 
 
252 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  41.88 
 
 
295 aa  222  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  38.93 
 
 
287 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  40.33 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  38.74 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  42.36 
 
 
297 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  40.94 
 
 
293 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  36.9 
 
 
290 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  44.3 
 
 
291 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  41.64 
 
 
293 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  40 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  40.6 
 
 
287 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  32.89 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  31.1 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  33.33 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  32.59 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.64 
 
 
713 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  29.1 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  42.17 
 
 
397 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  40.82 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  40.24 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.58 
 
 
807 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.16 
 
 
711 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  42.39 
 
 
408 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  30.56 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  28.28 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  39.33 
 
 
657 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  29.53 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.17 
 
 
709 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.17 
 
 
709 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.17 
 
 
709 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  28.28 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  40.66 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  39.58 
 
 
400 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.17 
 
 
709 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  28.28 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  39.58 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  28.28 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  39.58 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  28.28 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.77 
 
 
711 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  38.37 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.6 
 
 
776 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  39.56 
 
 
319 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.28 
 
 
711 aa  63.5  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.36 
 
 
713 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  63.2  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.6 
 
 
768 aa  63.2  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  28.19 
 
 
396 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.96 
 
 
713 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.3 
 
 
708 aa  62.8  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  28.19 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.96 
 
 
713 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.08 
 
 
712 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  37.21 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  39.51 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.78 
 
 
709 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.65 
 
 
711 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  29.77 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  30.87 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.5 
 
 
711 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  32.59 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.23 
 
 
722 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  28.19 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  29.05 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  28.92 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.36 
 
 
711 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  25 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.54 
 
 
715 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0617  methyltransferase related protein  35.87 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  30.22 
 
 
396 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  27.52 
 
 
400 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  29.01 
 
 
400 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  29.06 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  29.01 
 
 
425 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  29.01 
 
 
425 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  29.01 
 
 
425 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  29.01 
 
 
423 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  29.01 
 
 
425 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  29.01 
 
 
425 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  29.01 
 
 
425 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  25.74 
 
 
415 aa  60.1  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24675  hypothetical protein  31.88 
 
 
343 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  29.01 
 
 
422 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  31.5 
 
 
493 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.86 
 
 
706 aa  59.7  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>