More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1397 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
252 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  70.24 
 
 
294 aa  348  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  69.44 
 
 
288 aa  341  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  49.8 
 
 
298 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  53.15 
 
 
304 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  48.05 
 
 
385 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  47.01 
 
 
334 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  46.43 
 
 
314 aa  231  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  46.9 
 
 
381 aa  228  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  46.12 
 
 
386 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  46.51 
 
 
381 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  46.09 
 
 
365 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  45.7 
 
 
365 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  43.25 
 
 
291 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  45.8 
 
 
405 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  38.4 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  38.02 
 
 
291 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  42.23 
 
 
311 aa  175  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  39 
 
 
293 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  35.38 
 
 
290 aa  171  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  35.41 
 
 
291 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  36.05 
 
 
295 aa  161  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  33.46 
 
 
293 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  40.1 
 
 
297 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  38.04 
 
 
287 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  33.73 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  35.71 
 
 
560 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  32.47 
 
 
318 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  34.51 
 
 
412 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  32.12 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  31.39 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  28.75 
 
 
390 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  30.56 
 
 
297 aa  62.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  38.37 
 
 
397 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  29.19 
 
 
390 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  29.19 
 
 
390 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24675  hypothetical protein  27.69 
 
 
343 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  34.78 
 
 
395 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  35.96 
 
 
299 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  32.43 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.52 
 
 
722 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  31.51 
 
 
396 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  31.51 
 
 
396 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  40.24 
 
 
411 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.37 
 
 
709 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.37 
 
 
709 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  31.51 
 
 
396 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  31.51 
 
 
396 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  31.51 
 
 
396 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  32.23 
 
 
309 aa  58.9  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  31.25 
 
 
396 aa  58.9  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  38.32 
 
 
408 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.28 
 
 
738 aa  58.5  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.57 
 
 
725 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  28.76 
 
 
839 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  32.43 
 
 
313 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  31.78 
 
 
400 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  36.11 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.18 
 
 
725 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  36.11 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.92 
 
 
712 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  39.02 
 
 
397 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  31.25 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  32 
 
 
409 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.06 
 
 
711 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  34.33 
 
 
396 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  32.77 
 
 
396 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  29.93 
 
 
657 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  37.5 
 
 
397 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  35.19 
 
 
321 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  34.75 
 
 
400 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  35.19 
 
 
308 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.1 
 
 
701 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.6 
 
 
709 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.1 
 
 
711 aa  55.8  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  29.17 
 
 
321 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.81 
 
 
314 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.6 
 
 
709 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  32.56 
 
 
400 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  40.24 
 
 
384 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  28.17 
 
 
367 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  28.17 
 
 
391 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  27.74 
 
 
396 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  28.17 
 
 
396 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  28.17 
 
 
396 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  29.86 
 
 
396 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  28.17 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  23.86 
 
 
396 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  35.04 
 
 
404 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.68 
 
 
711 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  32.56 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  40.24 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  28.17 
 
 
367 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.34 
 
 
749 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.36 
 
 
725 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  40.24 
 
 
400 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  28.17 
 
 
396 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  28.17 
 
 
396 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  37.14 
 
 
399 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>