255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0657 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0657  type III secretion system inner membrane R protein  100 
 
 		 258 aa  494  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  35.53 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  25.47 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  27.53 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  27.69 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  28.33 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  28.08 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  27.73 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  24.49 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  27.62 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  26.69 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  27.31 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  24.8 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  27.57 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  25.4 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  26.85 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  23.68 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  27.11 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  25.46 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  25.3 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  24.1 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  26.16 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  25.71 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  25.91 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  27.19 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  25.59 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  23.67 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  24.51 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  28.26 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  27.52 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  24.7 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  23.61 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  26.97 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  28.37 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  26.24 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  26.34 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  27.48 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  26.24 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1868  flagellar biosynthetic protein FliR  24.28 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  27.11 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  25.88 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  29.95 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  23.72 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  25.82 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  25.65 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  26.75 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  26.48 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0961  type III secretion system inner membrane R protein  26.87 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  25.23 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  25.21 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  25.48 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  23.96 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  26.7 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  24.4 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  27.52 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  22.79 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  30.04 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  22.58 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  24.58 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  27.52 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  27.62 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  25.1 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  26.15 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  27.54 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  26.51 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.92 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06198  flagellar biosynthetic protein FliR  24.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  26.38 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  24.57 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  24.88 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00968  flagellar biosynthetic protein FliR  24.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  27.98 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  25.88 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  23.46 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  24.18 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  27.15 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  27.83 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  28.41 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  26.09 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  24.28 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1976  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  27.37 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  25.91 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  24.02 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  24.56 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  25.68 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  26.54 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  24.02 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2280  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  27.37 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102149  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  24.02 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  22.88 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  24.54 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  26.38 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  24.19 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  26.1 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  25.69 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  26.36 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  24.31 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>