231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0961 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0961  type III secretion system inner membrane R protein  100 
 
 		 255 aa  493  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  43.19 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  35.83 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  35.83 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  34.73 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  30.42 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  29.36 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  28.4 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  25.77 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  28.4 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  24.8 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  28.16 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  31.08 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  27.35 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  26.27 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  26.52 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  25.35 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  25.48 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  32.91 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  24.32 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  27.2 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  32.48 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  30.86 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  29.47 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  31.01 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  24.89 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  25.41 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  32.14 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  32.7 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  26.03 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  25.57 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  23.64 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  25.35 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  27.97 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  24.89 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  26.16 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  26.94 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  24.71 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  25.47 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  24.77 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  24.68 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  24.39 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  26.13 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  27.51 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  22.73 
 
 		 258 aa  72  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  24.42 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  27.08 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  25.22 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  22.94 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  27.24 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.03 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  26.09 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  29.11 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  23.39 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  28.05 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  24.89 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  27.06 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  29.78 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  22.5 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  25.83 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  26.32 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  25.83 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  23.87 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  23.95 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  27.75 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  23.11 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  23.11 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  23.11 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  24.11 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  24.11 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  23.27 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  23.11 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  27.19 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  24 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  24 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  25.33 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  28.41 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  24.11 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  23.79 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  23.32 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  31.17 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  26.09 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  23.32 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  26.57 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  23.32 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  23.32 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  22.67 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  22.97 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  24.89 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  23.38 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  29.63 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  23.38 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  22.92 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  23.02 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0657  type III secretion system inner membrane R protein  27.31 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  23.33 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  21.1 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>