85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0389 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0389  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 127 aa  257  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00329651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0553  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.962558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1702  thioesterase superfamily protein  52.34 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1879  hypothetical protein  46.46 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000386967  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0849  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0122  thioesterase family protein  36 
 
 		 177 aa  84  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1077  hypothetical protein  33.6 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.104838  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1346  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2061  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0996  hypothetical protein  35.25 
 
 		 192 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.673029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1059  hypothetical protein  34.43 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0813  hypothetical protein  33.61 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.154524  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0565  hypothetical protein  31.67 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  39.29 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1152  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  28.43 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000106679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.14 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.49 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.38 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  33.33 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1175  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.82 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000018345  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  31.58 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.8 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1728  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  27.59 
 
 		 200 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.99 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  33.33 
 
 		 251 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.3 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.55 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.03 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.24 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.54 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.55 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  32 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  35.53 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0934  hypothetical protein  40.35 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.39 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0637  hypothetical protein  40.35 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0764989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0938  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  22.81 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0267853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  32.93 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539.1  hypothetical protein  40.35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0622463  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.89 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3822  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.47 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00703376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.11 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.58 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.11 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.83 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.95 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.25 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.58 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.71 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.25 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.71 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0680  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  23.42 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000200917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.18 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.62 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.62 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  28.3 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  28.3 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.93 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.58 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0943  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  26.13 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000300169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.15 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.58 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.58 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.58 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 		 158 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.25 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.93 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  34.78 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.72 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.95 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3595  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  26.21 
 
 		 250 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1102  transcriptional regulator, DeoR family  26.85 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3613  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  26.21 
 
 		 250 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3705  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  26.21 
 
 		 250 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000903999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>