49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0553 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0553  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.962558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0389  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00329651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1702  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1879  hypothetical protein  46.83 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000386967  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0849  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1346  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0122  thioesterase family protein  31.2 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2061  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1077  hypothetical protein  33.61 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.104838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0565  hypothetical protein  31.75 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0680  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.22 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000200917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1728  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  27.42 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0938  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.66 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0267853  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0996  hypothetical protein  25.4 
 
 		 192 aa  50.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.673029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1059  hypothetical protein  25.4 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1175  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  32.23 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000018345  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0813  hypothetical protein  24.6 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.154524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1152  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.56 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000106679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.91 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.97 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.88 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1102  transcriptional regulator, DeoR family  28.72 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  42.19 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.85 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  30.21 
 
 		 152 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  40 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  35.8 
 
 		 251 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.8 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3822  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  26.6 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00703376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  34.38 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.8 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.8 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0637  hypothetical protein  35.8 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0764989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.68 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0934  hypothetical protein  35.8 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  34.38 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.46 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2077  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  31.46 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126885  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539.1  hypothetical protein  35.8 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0622463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1312  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  24.69 
 
 		 190 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1287  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  24.69 
 
 		 190 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.996878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>