14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0565 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0565  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1059  hypothetical protein  54.6 
 
 
192 aa  202  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0996  hypothetical protein  55.17 
 
 
192 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.673029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0813  hypothetical protein  54.6 
 
 
192 aa  202  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.154524  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1077  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  141  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.104838  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0122  thioesterase family protein  46.85 
 
 
177 aa  140  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2061  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1346  thioesterase superfamily protein  50.68 
 
 
180 aa  125  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0849  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
164 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1702  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1879  hypothetical protein  34.45 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000386967  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0389  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00329651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0553  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
129 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.962558  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  32.41 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>