27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0122 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0122  thioesterase family protein  100 
 
 
177 aa  362  1e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2061  thioesterase superfamily protein  75 
 
 
179 aa  276  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1077  hypothetical protein  51.57 
 
 
169 aa  169  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.104838  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0813  hypothetical protein  48.99 
 
 
192 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.154524  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0996  hypothetical protein  48.99 
 
 
192 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.673029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1059  hypothetical protein  48.32 
 
 
192 aa  148  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0565  hypothetical protein  47.48 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1346  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0849  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
164 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1702  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 
129 aa  93.6  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1879  hypothetical protein  37.9 
 
 
127 aa  89  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000386967  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0389  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
127 aa  84  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00329651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0553  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.962558  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3902  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.29 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000171979  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3992  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.29 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3868  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.29 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58951e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1290  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.29 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0131778  hitchhiker  0.000000000335465 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3613  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.29 
 
 
250 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3896  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.29 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000171057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3705  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.29 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000903999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2077  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  32.89 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3953  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.29 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3595  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.29 
 
 
250 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3677  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  28.28 
 
 
197 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2506  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  28.28 
 
 
197 aa  41.6  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1175  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  24.04 
 
 
197 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000018345  normal  0.032129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>