42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1702 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1702  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0389  thioesterase superfamily protein  52.34 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00329651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0553  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.962558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1879  hypothetical protein  44.7 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000386967  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1077  hypothetical protein  41.67 
 
 		 169 aa  94.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.104838  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0122  thioesterase family protein  41.73 
 
 		 177 aa  93.6  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0849  thioesterase superfamily protein  45.6 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1346  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2061  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0996  hypothetical protein  36.29 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.673029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1059  hypothetical protein  36.29 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0565  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0813  hypothetical protein  34.68 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.154524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  32.11 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3822  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  26.55 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00703376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1175  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  30.43 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000018345  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1728  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.82 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0938  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  27.27 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0267853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0680  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  26.21 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000200917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0943  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  27.36 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000300169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2506  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3613  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 250 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1290  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 220 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0131778  hitchhiker  0.000000000335465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3705  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 250 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000903999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3595  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 250 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3896  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000171057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3902  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000171979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3868  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58951e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3992  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3953  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 197 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3677  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.93 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1312  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  23.58 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1287  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  23.58 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.996878  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1102  transcriptional regulator, DeoR family  28.18 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2077  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  22.12 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.18 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  25.25 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.53 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.96 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.75 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.96 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0794  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  21.7 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>