58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1879 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1879  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000386967  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0389  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00329651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1702  thioesterase superfamily protein  44.7 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0553  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 129 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.962558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1077  hypothetical protein  39.34 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.104838  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0122  thioesterase family protein  37.9 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0849  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1346  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2061  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 		 179 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0565  hypothetical protein  34.45 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1059  hypothetical protein  30.83 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0996  hypothetical protein  30.83 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.673029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0813  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.154524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  32.43 
 
 		 188 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1175  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  31.62 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000018345  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3822  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  33.93 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00703376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2077  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  31.3 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.74 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.52 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1728  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  25.22 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.35 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.33 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  43.42 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.9 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.96 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.3 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.3 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.26 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.02 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.35 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  30 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.29 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.25 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.25 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.82 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.82 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.82 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.59 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  31.18 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  31.25 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.33 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.16 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.79 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.95 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.14 
 
 		 150 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.84 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0943  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  26.89 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000300169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.14 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.9 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.68 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.12 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.15 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  32.58 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.12 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>