30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0680 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0680  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000200917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0938  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  72.97 
 
 
188 aa  283  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0267853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1728  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  57.22 
 
 
200 aa  222  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1152  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  51.11 
 
 
191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000106679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  48.42 
 
 
188 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1102  transcriptional regulator, DeoR family  40.98 
 
 
194 aa  165  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0943  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  39.67 
 
 
194 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000300169  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1078  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  47.28 
 
 
198 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0274089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2506  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  46.02 
 
 
197 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1175  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  45.18 
 
 
197 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000018345  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3896  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.89 
 
 
197 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000171057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3868  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.89 
 
 
197 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58951e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3902  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.89 
 
 
197 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000171979  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3992  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.89 
 
 
197 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3953  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.89 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3613  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.89 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3705  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.89 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000903999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1290  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.89 
 
 
220 aa  154  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0131778  hitchhiker  0.000000000335465 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3595  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.89 
 
 
250 aa  154  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1969  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  46.96 
 
 
198 aa  154  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3677  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.32 
 
 
197 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3822  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  44.44 
 
 
189 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00703376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2077  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  40.64 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1312  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  39.88 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1287  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  39.88 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.996878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0794  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  37.91 
 
 
191 aa  122  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1341  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  37.58 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0553  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
129 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.962558  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1702  thioesterase superfamily protein  26.21 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0389  thioesterase superfamily protein  23.42 
 
 
127 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00329651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>