68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0849 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0849  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 164 aa  330  7.000000000000001e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0122  thioesterase family protein  46.77 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0389  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00329651  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0565  hypothetical protein  43.75 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1077  hypothetical protein  42.47 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.104838  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1346  thioesterase superfamily protein  46.88 
 
 		 180 aa  107  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1702  thioesterase superfamily protein  45.6 
 
 		 129 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2061  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0996  hypothetical protein  39.84 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.673029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1059  hypothetical protein  39.06 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0813  hypothetical protein  37.82 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.154524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1879  hypothetical protein  43.9 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000386967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0553  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.962558  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.43 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.43 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.43 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.43 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1728  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  29.06 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.34 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.55 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  28.3 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.46 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.91 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.06 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.93 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.79 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3822  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  27.43 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00703376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1175  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  27.12 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000018345  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.36 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  31.09 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  28.21 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.11 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.24 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.33 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.9 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  27.74 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.18 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  28.23 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.06 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.68 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.48 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.73 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0680  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  23.15 
 
 		 194 aa  43.9  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000200917  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.49 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.08 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.87 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.57 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.66 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.79 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  26.8 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1312  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  27.17 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1287  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  27.17 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.996878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.41 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.41 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.91 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.53 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.09 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.27 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.58 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0938  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  22.14 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0267853  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.52 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.52 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>