More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0594 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0594  peptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  100 
 
 		 562 aa  1157    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.564656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  37.06 
 
 		 580 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  36.62 
 
 		 562 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  36.51 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  37.38 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  37 
 
 		 550 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1828  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.3 
 
 		 539 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.011145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  35.77 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  34.95 
 
 		 547 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01271  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  36.12 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2352  extracellular solute-binding protein family 5  36.12 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1408  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.12 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2540  peptide transport periplasmic protein precursor  37.95 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1501  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.12 
 
 		 547 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2331  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 547 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  36.55 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01282  hypothetical protein  36.12 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856831  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1530  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.12 
 
 		 547 aa  372  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.414717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2171  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1892  extracellular solute-binding protein  38.14 
 
 		 547 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1784  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.14 
 
 		 547 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.75 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.101699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 541 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 		 541 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1878  peptide transport periplasmic protein SapA  35.96 
 
 		 557 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1458  peptide transport periplasmic protein SapA  35.96 
 
 		 549 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1640  peptide transport periplasmic protein SapA  35.96 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1816  peptide transport periplasmic protein SapA  35.96 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.440252  hitchhiker  0.00000000112139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  35.61 
 
 		 541 aa  363  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.12 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  34.66 
 
 		 541 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 		 541 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.55 
 
 		 556 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 		 541 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 		 549 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 		 551 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.27 
 
 		 542 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0479  peptide transport periplasmic protein precursor SapA  34.29 
 
 		 541 aa  333  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 		 544 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01870  hypothetical protein  33.15 
 
 		 539 aa  324  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 542 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003816  peptide transport periplasmic protein SapA  33.52 
 
 		 539 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1285  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  34.17 
 
 		 540 aa  320  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 543 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  31.12 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  31.12 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.12 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.12 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  31.12 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  31.12 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.12 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.12 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.58 
 
 		 542 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02835  putative ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.83 
 
 		 578 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 547 aa  303  6.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  32.01 
 
 		 542 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 		 542 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 		 542 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 		 542 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.86 
 
 		 526 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.86 
 
 		 526 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 542 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.86 
 
 		 526 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 542 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 		 532 aa  300  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 547 aa  300  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 544 aa  300  7e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 542 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  31.07 
 
 		 547 aa  298  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.67 
 
 		 526 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.67 
 
 		 526 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.01 
 
 		 574 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  32.01 
 
 		 542 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  32.01 
 
 		 542 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.28 
 
 		 542 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.63 
 
 		 542 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 531 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 506 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 553 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 531 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 532 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 		 531 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.63 
 
 		 542 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.63 
 
 		 542 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.63 
 
 		 536 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.63 
 
 		 542 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4568  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 553 aa  293  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 535 aa  293  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 535 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.36 
 
 		 535 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 		 531 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.87 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 541 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>