40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2548 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  100 
 
 		 274 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  54.3 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  45.49 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  46.13 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  44.74 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  43.39 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  42.29 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  41.78 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  42.86 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  34.39 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 		 575 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  33.86 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  33.33 
 
 		 397 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  29.22 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  32.81 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  39.44 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  32.3 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  31.38 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  32.48 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  30.93 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  32.16 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  32.68 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  28.34 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  36.3 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  25.42 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  28.8 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  32.19 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  33.53 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  24.7 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  22.27 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  30.34 
 
 		 283 aa  52  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  32.19 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  22.56 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  34.38 
 
 		 663 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  33.06 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  22.36 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.58 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  28.26 
 
 		 498 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.455704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>