28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1509 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  95.95 
 
 		 296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  69.93 
 
 		 289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  66.55 
 
 		 290 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  67.02 
 
 		 288 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  61.87 
 
 		 281 aa  340  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  61.89 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  48.93 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  47.28 
 
 		 498 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  25.76 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  30 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  31.55 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  27.81 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  30.2 
 
 		 302 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  25.17 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  31.68 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  29.58 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  28.65 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  27.22 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.68 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  26.78 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  27.86 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  24.18 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  25.15 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  29.19 
 
 		 663 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  27.81 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  27.03 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>