22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0866 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  611  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  51.79 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  52.98 
 
 
289 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  50.89 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  50.71 
 
 
296 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  48.93 
 
 
296 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  51.47 
 
 
281 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  49.64 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  39.84 
 
 
498 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  30.07 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  30.4 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  26.8 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  29.44 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  26.29 
 
 
239 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  27.53 
 
 
575 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  26.99 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  25.98 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  27.32 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  26.17 
 
 
289 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  30.73 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  25.32 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  26.71 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.230705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>