34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2275 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  100 
 
 		 295 aa  587  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  55.68 
 
 		 291 aa  291  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  29.75 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  30.32 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  32.81 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  29.37 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  32.17 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  31.94 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  27.68 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  38.02 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  32.09 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  31.05 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 575 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  30.46 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  25.86 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  30.53 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  34.78 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  30.06 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  30.43 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.62 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  25.42 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  26.7 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  29.01 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  30.81 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  26.88 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  29.79 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  26.99 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.11 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  29.46 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  28.12 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  29.1 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  26.51 
 
 		 344 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>