28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1362 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  100 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  62.28 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  61.4 
 
 		 293 aa  300  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  58.27 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  60.44 
 
 		 308 aa  260  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  52.89 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  39.68 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  36 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0115  hypothetical protein  38.93 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  35.38 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  29.55 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  33.99 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  31.68 
 
 		 575 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  31.62 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  29.37 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  32.09 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  34.26 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  33.9 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  34.62 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  32.08 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  31.34 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  27.4 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  29.75 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  28.86 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  27.59 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  33.08 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  30.13 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  30.26 
 
 		 344 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>