32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5122 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  50.38 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  44.74 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  45.85 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  41.44 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  48.16 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  42.86 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  40.31 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  44.78 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  40.43 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  38.84 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  38.1 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  38.21 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  35.82 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  36.49 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  39.68 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  41.27 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  34.03 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  32.07 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  30.94 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  28.64 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  31.28 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  31.14 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  39.17 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  30.72 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  27.9 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  30.51 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  34.11 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  37.3 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  30.83 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  34.29 
 
 		 663 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>