25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1489 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  100 
 
 
397 aa  726    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  64.98 
 
 
344 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  53.3 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  38.33 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  28.08 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  37.14 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  36.72 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  35.48 
 
 
302 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  39.53 
 
 
280 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  40.37 
 
 
239 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  33.33 
 
 
289 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  35.34 
 
 
285 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  34.15 
 
 
575 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  37.14 
 
 
280 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  33.87 
 
 
302 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  37.07 
 
 
279 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  29.65 
 
 
242 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  30.38 
 
 
271 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  38.18 
 
 
264 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  35.4 
 
 
275 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  34.38 
 
 
304 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  33.06 
 
 
311 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  36.07 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.62 
 
 
294 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  33.06 
 
 
264 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>