31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0102 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  100 
 
 
242 aa  472  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  41.86 
 
 
239 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  32.3 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  36.36 
 
 
302 aa  72  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  34.62 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  33.55 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  34.27 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  34.43 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  28.57 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  32.61 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  27.84 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  32.41 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  30.12 
 
 
575 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  30.46 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  30 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  26 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  28.73 
 
 
397 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  29.21 
 
 
344 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  29.2 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  28.29 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  31.2 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  29.78 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  28.47 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  30.51 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  35.45 
 
 
311 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  25.39 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  28.42 
 
 
310 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  32.38 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  26.78 
 
 
296 aa  45.4  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  26.78 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2927  hypothetical protein  27.86 
 
 
280 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>