29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2309 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  553  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  53.85 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  50.4 
 
 		 397 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  37.58 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  39.17 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  29.85 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  35.46 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  35.8 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  35.37 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  39.16 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  37.27 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  37.84 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  34.39 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  44.04 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  40.57 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  38.98 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.06 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  35.65 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  34.81 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  36.67 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  30.22 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  33.33 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  33.8 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  33.5 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  38.68 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.73 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.24 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  30.87 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  31.58 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>