37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1394 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  50.38 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  41.33 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  41.18 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  43.7 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  39.92 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  42.51 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  37.63 
 
 		 239 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  39.13 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  38.76 
 
 		 575 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  29.56 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  31.15 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  29.1 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  31.68 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  32.12 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  31.07 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  33.67 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  33.55 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  34.39 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  35.62 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  32.02 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  28.32 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  37.61 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  34.97 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  30.07 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  30.91 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  31.1 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  30.57 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  27.39 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  30.05 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  28.99 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  26.2 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  26.75 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  26.29 
 
 		 663 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>