25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3702 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  100 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  73.78 
 
 
290 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  71.63 
 
 
289 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  67.02 
 
 
296 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  66.9 
 
 
296 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  64.77 
 
 
281 aa  360  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  64.11 
 
 
310 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  50.89 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  43.33 
 
 
498 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  26.87 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  29.88 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  25.46 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  30.46 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  29.22 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  26.39 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  26.88 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  25.64 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  28.76 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  24.15 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  24.57 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 
575 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  24.03 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  24.29 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  25.49 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  22.84 
 
 
280 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>