27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3411 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  66.55 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  64.11 
 
 		 288 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  71.64 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  63.79 
 
 		 289 aa  371  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  61.89 
 
 		 296 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  60 
 
 		 296 aa  358  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  49.64 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  42.24 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  28.23 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  27.73 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  24.47 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  34.44 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  26.63 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  26.52 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  26.15 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  23.47 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  23.9 
 
 		 575 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  25.77 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  25.69 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  29.93 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  27.69 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  24.86 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  24.87 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  27.15 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  26.49 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  23.08 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>