23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1898 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  80.49 
 
 		 289 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  73.78 
 
 		 288 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  66.55 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  67.25 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  66.55 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  65.36 
 
 		 281 aa  348  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  51.79 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  43.15 
 
 		 498 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  26.44 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  25.91 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  27.63 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  31.08 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  31.17 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  26.83 
 
 		 239 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  24.68 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  28 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  28.12 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  28.38 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  24.03 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  25.39 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  26.45 
 
 		 575 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  24.57 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>