37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2706 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  78.57 
 
 		 280 aa  401  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  36.7 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  35.47 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  30.22 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  28.81 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  39.16 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  27.75 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  35.71 
 
 		 575 aa  68.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  37.14 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  31.22 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  27.68 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  31 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  30.99 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  30 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  35.33 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  29.23 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  29.5 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  28.66 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  32.17 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  33.76 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  28.95 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  32.92 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.08 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  25.64 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  28.38 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  38.57 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  28.99 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  27.22 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  29.11 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  28.22 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  29.09 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  30.73 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0115  hypothetical protein  34.55 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  29.93 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.77 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  31.25 
 
 		 498 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.455704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>