38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1899 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  100 
 
 		 293 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  61.4 
 
 		 283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  60.82 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  61.09 
 
 		 294 aa  281  8.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  58.16 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  46.61 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  37.06 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  35.71 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  34.13 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  34.71 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  35.97 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  36 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  36.13 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  35.2 
 
 		 575 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  33.09 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  30.37 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  26.67 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  34.38 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  28.76 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  31.68 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  34.19 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  28.92 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  29.28 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  30.25 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  30.89 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  32.03 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0115  hypothetical protein  38.39 
 
 		 242 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  34.15 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  28.66 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  30.37 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  32.77 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  32.08 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  23.78 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  36.79 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  29.71 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  25.69 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>