27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0383 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  630  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  63.69 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  55.45 
 
 		 307 aa  192  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  32.32 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  29.49 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  33.53 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  31.22 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  37.1 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  41.28 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  37.4 
 
 		 277 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  35.06 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  33.73 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  36.67 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  33.12 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  34.13 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  31.13 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  28.96 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  30.93 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  33.87 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  32 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  33.93 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  32.54 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  33.55 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  28.92 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  31.3 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  33.02 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>