38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0151 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  100 
 
 
285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  43.7 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  36.7 
 
 
279 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  35.21 
 
 
280 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  34.04 
 
 
575 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  29.02 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  32.46 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  28.64 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  35.06 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  28.02 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  25.78 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  33.08 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  28.27 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  26.87 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  36.17 
 
 
397 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  34.13 
 
 
344 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  28.99 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  27.72 
 
 
281 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  24.58 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  34.11 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  28.86 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  29.55 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  25.76 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  29.08 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  30.22 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  30.43 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  26.63 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  31.2 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  29.21 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  25.25 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  34.85 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  33.9 
 
 
279 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  29.28 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  25 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  25.85 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  31.9 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.3 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  28.37 
 
 
260 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>